佛手栽培品种，主要有贝加毛橙变种、酸橙的变种、柠檬留兰香变种、柠檬香蜂草的变种、拟美国薄荷和香橼变种。其中贝加毛橙变种和酸橙等品种主要在美国、意大利、德国、印度和阿根廷栽培；拟美国薄荷俗称野佛手，主产地在加拿大；柠檬留兰香的变种主要在日本和韩国栽培；中国佛手的主要栽培品种为香橼变种，在广东、福建、云南、四川和浙江有栽培，此种在印度也有大面积的栽培。
佛手按果形分为指佛手和拳佛手。按花的颜色分为红花佛手和白花佛手。红花佛手因花为红色而得名。可分为大种、小种两个品系。大种由福建漳州一带引入，又称为“福建种”。该品种生长健壮，树形高大，枝条粗壮直立，叶片肥大宽厚。叶脉明显，嫩梢嫩叶，花呈紫红花，花芽易分化。其果实大，量高，单果重一般为380克左右，果形顶端指状闭合如拳（即拳佛手）。由于其香气较淡，外观较差，果实含水量高，不耐贮藏，故种植较少。小种为嫩梢嫩叶，花呈淡红色，叶片较小且薄，叶脉平滑，节间较短，树形矮小，花芽易分化，坐果率高，果实较短小，单果重100克左右，香气浓，耐贮藏。可作为矮化盆景栽培，较有发展前景。白花佛手最早从南京、江苏一带引入，又称“南京种”。该品种花白色，与“福建种”比较，果实稍小，香气更浓；外观漂亮，果形多为指佛手（即顶端指状分裂）；适合盆栽和地栽；其种植历史悠久。根据枝干颜色，可分白皮、青皮两个品系。白皮枝干灰白色，节间长，叶呈淡绿色或黄绿色，大而薄，花芽分化差，坐果率较低，果实大而稍长，单果重350克左右，果皮细且光泽度好，香气浓郁，较耐贮藏。青皮为主栽品种，面积占90%以上。枝干青褐色，较粗壮，叶片较厚，叶浓绿色。花芽易分化，结果性好，丰产稳定，单果重300克左右（最大的可逾2000克），香气浓较耐贮藏。
根据产地不同，佛手又分为四种：广东、广西称“广佛手”；四川称“川佛手”；浙江称“金佛手”；福建称“闽佛手”。在云南种植的佛手称为“云佛手”。
4.4.2.1广佛手
广佛手树体高大，枝条下垂不明显，嫩梢呈紫红色，叶片大、呈深绿色，叶缘为波缘，花呈紫红色，果实呈大拳形、呈淡黄色，耐寒性差。其以药材销售为主，肇庆产地最佳，品质最优，为地道药材。
4.4.2.2金佛手
金佛手树体矮小、树形紧凑、枝条呈淡灰色，嫩梢呈淡绿色，叶片较小、呈青绿色，叶缘平缘，花呈白色，果中大、较耐寒，适宜盆栽。金佛手种质资源较丰富，有3个栽培品系：白衣秀士、青衣童子和赤金王子。白衣秀士的新梢生长较慢，发芽数多、分枝多，果实小，适于培育小果矮化盆景；赤金王子的新梢生长快、果实大、单株产量高，适于以产果和深加工为生产目的的种植；青衣童子相关生理指标和生长发育特性介于上述白衣秀士和赤金王子之间，适于盆景，也适于产果生产目的的种植。
4.4.2.3川佛手
川佛手树体高大，枝条呈褐色、易披散，嫩梢呈暗紫，叶片大、呈深绿色，叶缘波缘，花呈紫红色，果实呈大拳形、长椭圆形或近筒状、果皮呈淡黄色、粗皱，耐寒性略差。
4.4.2.4闽佛手
闽佛手树体矮小、树形紧凑，枝条呈灰褐色，嫩梢呈紫红色，叶片较小、呈深绿色，叶缘平缘，花呈淡紫红色，果实短小、开指、果皮呈棕黄色，不耐寒。
4.4.2.5云佛手
云佛手树体高大，老枝呈灰绿色，幼枝略带紫红色，有短而硬的刺。叶片革质，长椭圆形或倒卵状长圆形，边缘有浅波状钝锯齿。叶色淡绿，花呈紫色，果实卵形或长圆形，成熟果实内在质地较紧密，金黄色，有光泽，果皮粗糙，有许多皱褶，适于果生产目的种植。