云黄连属于林下草本植物，在人工栽培过程中，为了获得较高的经济效益，不仅要考虑产量和质量，还要考虑综合效益。经过对栽培技术的探索研究，各地形成了一些高效栽培模式和复合经济种植模式，下面简要介绍云黄连林下栽培技术要点。
选地宜选用郁闭度较好的矮生常绿或落叶阔叶混交林、常绿针阔叶混交林，不宜选用高大乔木林。
整地前进行熏土，方法是：选晴天将土表的腐殖土翻起，拣净树根、石块，待腐殖土晒干后，收集枯枝落叶和杂草进行熏土。此法有利于提高土壤肥力，减少病虫害和杂草。熏土后耕翻15厘米，拣净树根等杂物，耙匀整平，做成宽130～150厘米、高20～30厘米的畦，畦沟宽50厘米。
5月上旬果实由绿变黄，种子变黄绿色，应及时采收，否则种子会脱落在地里。选晴天采下果枝，放室内阴干1～2天后即可脱粒（因日晒后难以脱粒）。
种子脱粒后用冷水选种，去掉果皮。在冷凉的阴山坡挖地做高畦，畦宽100厘米，将畦中心的土挖去，四周留壁15厘米厚，池底铺沙，将湿种子倒入畦沟内，盖纯沙3厘米厚，在池上搭棚，封严四壁，防止鸟雀掏食种子，常检查，直到11月播种。
10—11月用经贮藏的种子与20～30倍的细腐殖土拌匀，均匀撒于做好的畦面，播后盖0.5～l.0厘米厚的干细腐熟猪牛粪(厩肥)或细土，上面再盖一层草或其他覆盖物保湿。用种量2.5～3.0千克/亩，可育出苗45万株左右。播种后搭棚遮阴，1畦1棚，棚高60厘米，郁闭度控制在80%左右，如采用林间育苗，必须于播种前调整好郁闭度。
幼苗在播后第三年移栽，可在2—3月、6月或9—10月等3个时期进行，尤以6月移栽最好，但低海拔地区最好在2—3月或9—10月移栽。具体操作是：先从苗床拔苗，洗净根上泥土便于分苗，剪去须根，只留1厘米长的根，按株行距10厘米的正方形栽植，用小铲开穴，穴深3～5厘米，栽后地面留3～4片叶，栽苗80～90株/平方米，折合栽苗5.3万～6.0万株/亩。通常上午挖苗，下午栽种，挖起的苗，当天未栽完，应摊放阴湿处。第二天栽前，用生根粉液（1升水对0.05～0.10毫升生根粉液）浸根10分钟，可明显提高云黄连苗移栽的成活率，促进其生长发育。
（1）苗期管理。播种后，次年3—4月出苗，出苗前应及时除去覆盖物。当苗具有1～2片真叶时，按株距1厘米左右间苗，6—7月在畦面撒一层约1厘米厚的细腐殖土，以稳苗根。
（2）中耕除草。育苗地杂草较多，每年至少除草3～5次，移栽后每年除草2～3次。如土壤板结，宜浅松表土。
（3）追肥、培土。育苗地在间苗后，每亩施稀粪水2000千克，8月再撒施干牛粪200千克，翌春再施入以上肥料，但量可适当增加。移栽后2—3月施1次稀粪水，10月和以后每年3—4月、10月各施肥1次。春肥以速效肥为主，秋肥以农家肥为主，每次每亩施2000千克左右。施肥量可逐年增加，施肥后应及时用细腐殖土培土。
（4）调节郁闭度。不管是荫棚还是林间，都应注意调节适宜光照条件，以利云黄连正常发育。一般移栽当年郁闭度以70%～80%为宜，以后每年减少10%左右。收获的那年，可于6月拆去全部棚盖物和间作树枝叶以增加光照，抑制地上部分生长，增加根茎产量。
（5）病虫害防治。
①白粉病。发生于5月下旬，6—7月较重，主要危害叶部。防治方法：适当增加光照，并注意排水；发病初期，将病叶集中烧毁；用70%甲基托布津500倍液喷施。
②炭疽病。主要危害叶片，严重时致全株枯死。防治方法：冬季注意清洁田园；用1:100～1:150倍波尔多液，或70%代森锰锌可湿性粉剂800～1000倍液喷雾。
③白绢病。6月初发生，7—8月危害严重，危害全株。防治方法：拔除并烧毁病株，用石灰粉处理病穴，或用40%多菌灵可湿性粉剂800倍液淋灌。
④蛞蝓。每年3—11月都有发生，咬食嫩叶，雨天危害严重。防治方法：用蔬菜毒饵诱杀；清晨撒石灰粉。
云黄连一般在移栽后5年收获，收获宜在9—10月地上部分枯黄时采挖。采收时，选晴天挖起全株，抖去泥土，剪下须根和叶片，即得鲜根茎。鲜根茎不用水洗，应直接干燥。干燥方法多采用炕干，注意火力不能过大，要勤翻动。干到易折断时，趁热放到槽笼里撞去泥沙、须根及残余叶柄，即得干燥根茎。须根、叶片经干燥去泥沙杂质后，亦可入药，残留叶柄及细渣筛净后可做兽药。
云黄连移栽后2年就可开花结实，但以栽后3～4年生植株所结的种子质量为好，数量也多。采收一般选5月中旬的晴天，将果穗摘下，盛入细密容器，置室内或阴凉地方，经2～3天后熟后，搓出种子，再用2倍于种子的腐殖细土或细沙与种子拌匀后层积保藏。