阿佤山地属亚热带低纬地区，地势复杂，海拔高低差别很大，最高海拔为 2800 米，最低海拔为 300 米。因这里的气候垂直变化显著，最高气温达 40℃，最低至 0℃。常年雨量 1500 ～ 3000 毫米，其中 80% ～ 95% 的雨量降于 5 月下旬至 10 月底，这段时间是阿佤山的雨季，其他月份为干季。阿佤山的土壤有砖红壤、赤红壤、红壤、黄壤、黄棕壤、棕壤等，又可划分为亚高山灌丛草甸土、紫色土、水稻土等 9 个土类，28 个土属，94 个土种，其中，水稻土种 14 个，旱作土种 30 个，多属砂壤。少数中壤、砖红壤分布在海拔 600 ～ 800 米的河谷地带，赤红壤分布在海拔 800～1300 米的地带，红壤分布在海拔1300 ～ 2100 米的地带，黄壤分布在 2100～2500 米的地带，黄棕壤分布在 2500 ～ 2900米的地带。