水芹在云南省栽培历史悠久，主要分布在昭通市、大关县、鹤庆市、大理州、维西县、碧江、贡山县、昆明市、富民县、西双版纳州、西畴县、文山市、麻栗坡县等地，生长于海拔1000～2800米的沼泽、潮湿低洼处及河边。水芹是云南民间食用较为广泛的野生蔬菜之一。