藕田应选保水性好，含有机质在1.5%以上的肥沃田块。深水种植应选水位较稳、水流平缓，汛期最高水位不超过1米的湖荡，并要求淤泥层较厚，土壤较肥。浅水藕多为水田栽培，宜选择水位稳定、土壤肥沃的水田种植。
用肉质根状茎繁殖，传统的莲藕生产上用整藕做种，每亩用种量为200～300千克，成本较高。李双梅等（2003）研究了用主藕、子藕和整藕做种繁殖的对比试验，结果表明，用子藕做种的，植株生长前期和中期生长较快，但三种繁殖方式不影响莲藕的熟性，对地下茎的产量、单支藕重等性状无显著的影响，说明子藕、主藕、整藕均可用于莲藕的繁殖，特别是用子藕做种，省力、省种。如用子藕做种，则子藕必须粗壮，至少有2节以上充分成熟的藕身，且顶芽完整。播种时，在当地平均气温上升超时15℃时定植，云南一般在3月中下旬定植。栽藕时力求灌浅水，田间保持水深3～5厘米，各行栽植穴宜交错排列，种藕顶芽一律朝向田内。栽时将种藕顶芽朝确定的方向稍向下斜插入，后把节稍向上翘，使藕身前后与田面呈20～25°斜角，可促进萌芽。
浅水田栽种密度因品种、肥力条件而定，一般早熟品种密度要大，晚熟品种密度要稀，株行距一般为l00厘米×150厘米或150厘米×200厘米。定植的方法是，先将藕种按一定株行距摆放在田间，行与行之间各株交错摆放，四周芽头向内，田间芽头应走向均匀。栽种时，将种藕前部斜插泥中，尾梢露出水面。种藕宜随挖随栽。
莲藕都在当地春季断霜后种植，夏季开始采收嫩藕，秋冬采收老熟藕，在越冬不致受冻的条件下可暂留田间，陆续采收到第二年春。浅水莲藕利用水田栽培，常与其他水生蔬菜或水稻实行轮作，其前茬、后茬作物常为慈姑、荸荠、水芹、茭白和水稻等。深水莲藕利用湖荡种植，常种植1次，连收3～5年，然后换茬，多与蒲草、芦苇轮换种植。
水田应于栽前半月以上及早耕翻，施足基肥，一般每亩施入腐熟厩肥或粪肥3000千克或腐熟粪肥+青草2000千克和生石灰80千克，放入浅水，耙耱平整，并加固田埂，以防漏水、漏肥。湖荡也应尽可能平整底土。
水层管理，栽后应按前期浅、中期深、后期浅的原则加以控制。莲藕栽种初期宜浅，保持5～10厘米的浅水，有利于水温、土温升高，促进萌芽生长；随着气温的升高和立叶的逐步高大，水位宜逐渐加深，水层加至10～20厘米，浅水藕最深25～35厘米，深水藕最深0.8米；水位过高时应尽力排放，要防止淹没立叶，引起死亡；后期进入结藕期，天气转凉，水位应逐步排浅，下降到10厘米左右，防止莲藕受冻，农谚“涨水荷叶落水藕”，意即在此。
莲藕栽植成活以后，要及时除草，直至立叶基本封行为止，共进行2～3次，并要注意不踩伤地下茎。早熟莲藕施肥1～2次，中晚熟莲藕施肥2～3次。浅水藕一般追肥2～3次，即在抽生少数立叶时追施发棵肥，每亩施腐熟有机肥1000千克或尿素13～20千克；如植株生长仍不旺盛，可在2～3周后再追肥1次，除氮肥外，还应加施过磷酸钙和硫酸钾13～20千克/亩。田间出现少数终叶时，再重施1次催藕肥，每亩施入腐熟的粪肥1300～2000千克，外加硫酸钾15千克。施肥应选无风天气，上午露水已干后进行，以防化肥沾留在叶片上。每次施肥前应放干田水，以使肥料融入土中，次日还水。深水藕施化肥易溶于水，并随水流失，一般都用绿肥或腐熟厩肥塞入水下泥中，注意勿伤地下茎；也可将化肥与河泥混合均匀，做成肥泥团，稍干后，塞入水下泥中。
莲藕旺盛生长期，藕鞭在地下伸长迅速，常见有顶芽（藕头）穿过田埂，形成田外结藕（逃藕），在此期间须常下田检查。当新生的卷叶在田边抽生，距田埂仅1米左右时，应在晴天下午扒开表土，轻轻将藕梢转向田内，把盖泥压稳，以防移动。多数的莲藕品种都开花结实，在其生长期内可将莲子摘除，有利于营养向地下部位转移，也可防止莲子老熟后落入田内发芽，造成生物学混杂。
1.腐败病
腐败病通过种藕和土壤传播，为害地下茎，严重时地下茎呈褐色至紫黑色，地上部也会受到影响，从病茎抽出的叶片青枯萎蔫，严重时造成全株甚至成片枯死。防治方法：①实行合理轮作，与其他水生蔬菜2～3年轮作，或与水稻轮作，防病效果好。②采用无病种藕，洗净晒干，再用50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液或50%甲基硫菌灵可湿性粉剂800倍液均匀喷雾后，用塑料薄膜覆盖密封24小时。③施用腐熟有机肥。④栽前撒施50%多菌灵可湿性粉剂2千克/亩后耕翻。
2.病毒病
莲藕病毒病又名僵藕，为近年发现的新病害，它造成莲藕发芽延迟，生长衰退，藕身僵硬瘦小，出现多数褐色斑，顶端常扭曲、畸形，成为废品。多年连作田病害加重。防治方法：①实行合理轮作。②选用无病种藕。③增施腐熟的有机肥，以改善土壤理化性状。
3.斜纹夜蛾
斜纹夜蛾又名莲蚊夜蛾，多以蛹越冬，云南地区可终年发生。成虫昼伏夜出，卵多产于莲叶的背面叶脉交叉处，卵粒叠成2～3层块状。初孵幼虫群聚取食，可吐丝下垂随风飘散或从水面迁至其他植株。4龄幼虫畏光，大多在阴暗的下部叶取食，其后夜出为害，进入暴食期。此虫喜高温、高湿环境。化学防治应在低龄幼虫期及时喷药，可选用10%溴氰虫酰胺可分散油悬浮剂10～14毫升/亩对水60千克、20%虫酰肼（米满）悬浮剂1500倍液或5%氟啶脲（抑太保）乳油1500倍液等轮换喷雾防治。
4.莲缢管蚜
莲缢管蚜一年发生多代，4月下旬至10月均可发生，以有翅蚜从露地桃、李、杏、樱桃等越冬宿主上迁至藕田等水生蔬菜上繁殖为害。莲缢管蚜喜高湿环境，不耐高温，初夏和秋季发生严重，为害叶芽、花蕾、幼嫩立叶，降低产量和质量。防治方法：①成片种植，减少春夏茬混栽及莲藕与慈姑混栽。②适度密植，防止田间郁闭，清除田间浮萍。③可选用50克/升双丙环虫酯可分散液剂10～16毫升/亩对水60千克、25克/升高效氯氟氰菊酯（功夫）乳油2500～4000倍液、10%吡虫啉(艾美乐)水分散粒剂10～15克/亩对水60千克、22%噻虫·高氯氟微囊悬浮剂5.6～11.2毫升/亩对水60千克或10%溴氰虫酰胺可分散油悬浮剂30～40毫升/亩对水60千克等轮换喷雾防治。
5.食根金花虫
食根金花虫俗称水蛆。大多1年1代，幼虫入土以尾钩固定虫体于地下茎前端，为害根须和地下茎幼嫩部位；成虫咬食叶片，叶片呈缺刻和孔洞。防治方法：①冬季排除藕田积水，实行水旱轮作。②春季栽藕时结合整地，施5%辛硫磷颗粒剂3千克/亩，拌20千克/亩细土或尿素撒施。③在为害期，采用50%西维因可湿性粉剂2千克/亩，加细土5千克/亩制成毒土，于午后或傍晚撒在放干水的藕田中，翌日放浅水，3天后正常灌水管理。
1.采收
当终止叶叶背面微红，早生立叶开始枯黄时，即可采收嫩藕，就近上市。根据后把叶和终叶的走向，可确定地下藕的位置。当大部分立叶枯黄时，可采收老熟藕。莲藕可在防止受冻的条件下，留田陆续采收到次春萌芽前。冬季地上荷叶全枯，但手摸到终止叶叶柄，仍感柔韧，据此可找到地下藕的所在位置。
子莲陆续开花结莲，莲子陆续成熟，须分多次采收。莲子一般在花后30～40天可成熟采收，具体时间因结果期内气温高低而异，一般当莲蓬上莲孔边缘稍带黑色，莲子呈灰褐色时为适度成熟，即可采收。采收过早，莲子太嫩，含水量大；采收过迟，莲子的果皮坚硬如铁，不易剥皮。较大而饱满的莲子可制通芯千白莲子，价格较高。制法时：先用小刀剥去果皮，再徒手除去内层种皮，并推擦干净，随即用火柴棒或小竹签对准两片肥厚子叶（食用部分）中间夹生的莲芯（胚芽），从下向上将莲芯捅出（莲芯另做药用）。莲子即成洁白、圆满、中空的通芯白莲，晒干后可包装运销或贮存。一般比较瘦小的莲子，采用机械加工，去果皮（去壳）后，制成连芯、干莲子。
2.留种
无论藕莲、子莲，都要选用在田间越冬的老熟主藕和子藕做种。应选品种纯正、优质高产的田块做留种田。长江流域及其以南地区，在越冬期内，气温一般不会低于-8℃，可在留种田保持浅水，以防土壤冻裂，保护种藕。华北地区气候严寒，气温有时低于-10℃，可在田间覆盖一层稻草，以防止土壤冻结或冻裂。春季栽藕时挖种藕，随挖、随选。一般留种田面积占计划新栽藕田面积的1/6～1/4。