芹菜属于低温绿体春化的长日照植物，耐寒性较强，在高温干旱条件下生长不良。由于芹菜喜冷凉、较耐寒，故大部分地区的芹菜种植多以秋季栽培为主，露地越冬栽培则因各地区气候条件不同而异。一般冬季平均气温不低于-5℃的地区，芹菜不需保护设备便可越冬；冬季平均气温在-10℃以下的地区，需架设风障、进行地面覆盖才能安全越冬。
由于各地的自然条件及种植习惯不同，故芹菜的播种方式也有所不同，以育苗移栽、直播为主。近年来秋播以育苗移栽为主，待苗长至12厘米高时，以1:2的比例，拣大苗移栽。每亩直播用种量1000克左右，播种期一般安排在6月下旬至7月初，由于该时期气温较高，因此需在室内浸种催芽后播种。先用清水浸4～6小时后沥起，再放冰箱冷藏室处理，然后在室内阴凉处催芽，待种子露白后即播种于整理好的床土上。早秋芹菜播种后，一定要用遮阳网等覆盖物遮阳覆盖，以降低地温，防止水分蒸发，保证齐苗。应选择地势较高的地块或采用高畦育苗，做到能灌能排。基肥以腐熟农家肥为主，并混施磷、钾肥。在育苗期要特别注意水分的掌握，一般以小水勤浇为原则，保持土壤湿润。当有1～2片真叶时，结合间苗除净杂草，间苗前后轻浇一次水。间苗浇水后盖一层薄土，以后视生长情况追施速效性氮肥，基肥未曾用磷肥的可补施速效磷肥。此外，要根据苗龄的增长和当地的自然条件，白天逐步缩短遮阳时间，直到全部撤除遮阳设备，使幼苗得到锻炼，增强其对高温的适应性。
提前一星期，将土壤翻耕熟化，结合整地，亩施商品有机肥500千克、蔬菜专用复合肥50千克，结合整地撒施翻入土中。基肥中也可适当地配施少量化肥，特别是磷、钾肥，一般每亩施复合肥50千克。耕翻耙平后，整成1.0～1.2米宽呈南北方向的畦等待移栽。
芹菜的栽培密度因品种不同而异，一般行株距均约为13厘米，单株定植，深度适宜，以浅不露根、深不瘀心为度，栽苗时要注意选优去劣。待苗长至12厘米高时，可选择阴天或晴天的傍晚移栽，并做到移栽前浇足底水，移栽后搭棚遮阳，或移栽在保护地大棚内，用遮阳网覆盖。全畦栽完立即浇定植水。
1.浇水
芹菜性喜湿润，秋芹菜生长前期多处于高温季节，浇水宜勤，但每次浇水量不宜过多，定植后2～3天浇缓苗水。一般用天达2116状苗灵或植物活力酶对水喷施利于幼苗的快速生长和促进新根的产生。缓苗后一般应有短期的控水阶段，进行蹲苗锻炼。蹲苗时间的长短，视当地土质而定。蹲苗后，土壤表皮表现出白时，就应及时浇水，随着气温的下降，浇水次数应逐渐减少。
2.追肥
芹菜为浅根性植物，栽植密度又大，除应充分施用基肥外，在生长期间适当追肥是芹菜高产优质的保证条件。追肥以氮肥为主，并注意磷、钾肥的配合应用。一般追肥2～3次，每次每亩施尿素5～8千克，把握淡肥勤施的原则，确保养分的均衡供应。在土壤追肥的基础上，还应进行2～3次叶面追肥，一般可喷施0.5%尿素或0.3%磷酸二铵液；若土壤中钙、硼不足，可分别喷施0.3%氯化钙和0.1%硼酸液或多元微肥，改善芹菜的营养条件，提高芹菜产量和品质。
3.中耕除草
芹菜生长期间容易滋生杂草，要及时拔除，中耕除草宜浅不宜深。
4.培土软化
芹菜经过培土软化后，可使食用部分薄壁组织发达，柔白脆嫩，色泽佳，风味美，品质提高。一般在秋后，芹菜长到约30厘米左右时开始分期培土。因培土后一般不宜浇水，故培土前要充分灌水。每次培土的厚度，以不埋没心叶为宜。培土要在晴天无露水时进行，操作时不可损伤茎叶，避免因培土造成腐烂。
1.主要病害防治
（1）斑枯病。
1）识别要点：该病主要为害叶片，又叫叶枯病。自植株下部向上发展，初时病斑圆形浅黄色，水浸状，边缘明显，以后发展为不规则形。斑块颜色由浅黄色变灰白色，其上布生小黑点，为病菌的分生孢子器。叶柄及茎受害时病斑椭圆形，颜色稍深，微凹陷。病斑周围常有一圈黄晕，分生孢子器多发生在斑纹周围，拥挤在一起。病害严重时，造成叶枯。
2）病因：以菌丝潜伏在种皮内，附着在种子上、病残体或在采种母根上越冬。潜伏在种皮内的菌丝存活1年以上，附在种子表面病菌存活2年以上，病斑上的分生孢子存活8～11个月。病菌遇环境适宜，即形成分生孢子器及分生孢子，借风雨、人畜、工具等传播，遇有水滴分生孢子的萌发，产生芽管，从气孔或穿透皮层侵入。此病在气温20～25℃、多雨或湿度大的较冷凉气候环境条件下易流行。持续时间比较长，发病重。
3）防治方法：①做到从无病地、无病株上采种。使用2年内的种子，播前要用48～49℃的温水浸30分钟，边浸边搅拌，然后移入凉水中冷却，晾干后播种。②实行2～3年轮作，施足底肥，及时追肥。切忌大水漫灌，雨后排水，保护地做好通风排湿。③发病初期，可选用75%百菌清可湿性粉剂600倍液、1:0.5:200波尔多液、50%硫磺悬浮剂200～300倍液、8%甲霜灵·锰锌可湿性粉剂500倍液等轮换喷雾防治；每隔7～10天喷施1次，连续防治2～3次。
（2）病毒病。
1）识别要点：该病从苗期至成株期均可发病，全株受害。染病株发病初始表现为叶片皱缩，呈现浓、淡绿色斑驳或黄色斑块症状的明显黄斑花叶，叶色褪绿，叶面皱曲，新生叶片偏小，有的叶片扭曲、变窄，叶柄纤细。发病严重时，植苗心叶节间缩短，全株叶片皱缩，停止生长或黄化、矮缩。发病晚的多见于所生叶呈浓、淡绿相间的花叶，植株正常。
2）防治方法：①灭蚜防病。灭蚜是预防病毒病传染的关键环节。从出苗到采收的整个生育期间，都要搞好灭蚜工作，苗期灭蚜尤其重要。②加强田间栽培管理。适时播种，合理密植，施足有机基肥，加强肥水管理，促进植株健壮，提高抗病能力。农事操作中，接触过病株的手和农具，应用肥皂水冲洗，防止接触传染。保护地使用防虫网覆盖，把昆虫挡在棚外。③化学防治。在田间发病始见时开始，可选用20%盐酸吗啉胍（病毒A）可湿性粉剂500～600倍液、0.1%硫酸锌溶液或15%病毒必克可湿性粉剂700～1000倍液等轮换喷雾防治；每隔7～10天喷施1次，连续防治2～3次，能减少感染，起到防治作用。
（3）根结线虫。
1）识别要点：主要危害根系，幼苗期主要侵害主根，成株期和半成株期多侵害幼嫩侧根和细根。根部受害后形成大小不等、链珠状或葫芦状肿瘤，初期乳白色至乳黄色，以后变褐腐烂。受害幼苗或植株生长缓慢，叶色褪绿变黄，由外叶向心叶发展，最后萎蔫死亡。
2）防治方法：①有条件实行轮作的地方，可在病地改种韭菜、葱、蒜等，轮作3年；也可换大田土壤种植。②无法轮作的病地可采用物理（高温）防治方法，因为根结线虫多分布在20厘米的土层内，其中耕作层5～10厘米处最多。它的生存与土温有密切关系，土温40℃以上，线虫大量死亡，55℃经10分钟即全部杀死。所以，可利用三夏高温期间，采用清洁田园的方法，把病根彻底清除出田外深埋或烧毁；接着深翻土壤40厘米，起高垄30厘米；然后浇水，使垄沟里装满水，直至饱和；铺盖地膜，密闭棚室7～10天，杀线虫的效果很好。应注意的是，垄沟里要不断浇水。③无病土育苗。采用大田土或其他无病土进行育苗。④施清洁肥料。有机肥不能带有根结线虫的病残体，而且有机肥要经过充分腐熟。在病地用过的农具要经过消毒（或火烤）或擦洗干净，并防止人、畜的传播。⑤药剂防治。可采用10%噻唑膦（福气多）颗粒剂10克/株沟施，或采用10%氟吡菌酰胺（路富达）悬浮剂1500～3000倍液，整个芹菜作物生育期滴灌施药2～3次；也可选用1.8%阿维菌素乳油4000倍液灌根，10～15天后再灌1次。
（4）菌核病。
1）识别要点：芹菜菌核病可为害叶片、叶柄和茎。一般叶片首先发病，呈暗色污斑，潮湿时表面密生白色霉层，然后向下蔓延引起叶柄和茎发病。受害部位呈褐色水渍状，形成软腐，表面长出白色菌丝，最后茎组织腐烂呈纤维状茎内中空，形成鼠粪状黑色菌核。农户一定要高度注意该病，做到早发现、早防治，减轻损失。
2）防治方法：发病初期开始，可选用70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液或65%甲霉灵（硫菌霉威）可湿性粉剂1000倍液等轮换喷雾防治；每隔5～7天喷施1次，连续防治2～3次。以上农药应交替使用，可避免产生抗药性。
（5）黑斑病。
1）识别要点：芹菜黑斑病又称假黑斑病，是一种真菌性病害，主要为害叶片。该病病斑近圆形，深褐色，边缘清晰，病斑大小6～8毫米，有时发生于叶缘；病斑中部有稀疏黑霉，易开裂破碎。
2）防治方法：①选用抗病品种。②采用高畦栽培；开好排水沟，避免畦面积水；切忌大水漫灌。夏天采用遮阳网覆盖。③从无病植株上采种，种子存放2年后播种。如采用新种，要在49℃温水中浸种30分钟，边浸边搅拌，之后移入冷水中降温，晾干后播种。④保护地栽培要注意排湿，缩小日夜温差，减少结露。白天温度控制在15～20℃，高于20℃时要及时放风；夜间温度控制在10～15℃。⑤保护地栽培的芹菜，当苗高3厘米后，每亩每次用45%百菌清烟剂250克熏蒸，或喷撒5%百菌清粉剂1千克。⑥发病初期，选用70%甲基托布津可湿性粉剂800倍液或50%多菌灵可湿性粉剂600倍液轮换喷雾防治，每隔7～10天喷施1次，连续防治2～3次；采收前7天停止用药。
（6）软腐病。
1）识别要点：主要发生于叶柄基部。发病初期出现水浸状小斑点，淡褐色，很快扩展形成纺锤形或不规则形的凹陷斑，显湿腐状，后期变黑发臭，仅留表皮。有时从茎部发病，造成整株腐烂。
2）防治方法：①重病地块实行2年以上轮作。加强栽培管理，浇水或雨后及时松土，但不可伤根。发现病株及时挖除并撒入石灰消毒，控制浇水不能使土壤湿度过大，有条件可采用滴灌的方法。②发病初期用20%吗啉瓜乙铜600倍+硫酸链霉素2000倍液+绿叶先锋600倍液喷雾，或用20%乙酸铜500倍液+绿叶先锋600倍液喷洒，也可用20%叶枯唑（叶枯宁）600倍液+绿叶先锋600倍液喷雾。以上农药隔5～7天喷施1次，连续防治2～3次。
（7）枯萎病。
1）识别要点：芹菜苗期感病后，生长缓慢，发病重时幼苗萎蔫或枯死。成株感病后，叶片无光泽，叶色变暗淡，严重时叶片失绿或脉间叶肉出现黄绿相间斑驳，剖开病茎可见维管束变褐或根及根颈部、叶柄变为红色。根系腐烂，最后整株枯死。
2）防治方法：①选用抗枯萎病品种。采用高畦或起垄栽培。施用腐熟有机肥，雨后及时排水，严禁大水漫灌。重病地实行3年以上轮作。②药剂防治。发现病株后，选用10%混合氨基酸铜络合物（双效灵）水剂300倍液或75%百菌清可湿性粉剂600倍液等轮换灌根防治。
（8）根腐病。
1）识别要点：主要为害根部和茎基部。被害处开始产生水浸状红褐色斑，后来变为暗褐色或黑褐色，稍凹陷，叶片变黄，由下往上发展，但叶片不脱落。主根被害腐烂或坏死，侧根少，植株萎蔫枯死，容易拔出。
2）防治方法：①农业措施实行轮作，用无病菌土壤育苗或进行床土消毒。②药剂防治。病害刚刚发生时，采用50%多菌灵可湿性粉剂600～800倍液灌根防治，每隔10天再灌1次。
（9）生理性病害防治。
1）缺氮。①识别要点：植株生长缓慢，瘦弱，直立。从外部叶开始黄白化至全株黄化。老叶变黄，干枯或脱落。新叶变小。②防治措施：施入充分腐熟的优质厩肥作基肥；缺氮时及时补施碳酸氢铵；叶面喷施0.5%～1%尿素溶液，喷施时间要选在晴天，必要时可以喷2～3次，每次间隔7～10天。
2）缺磷。①识别要点：植株生长缓慢，叶片变小但不失绿，外部叶逐渐开始变黄，但嫩叶的叶色与缺氮症相比，显得更浓些，叶脉发红，叶柄变细，纤维发达，下部叶片后期出现红色斑点或紫色斑点，并出现坏死斑点。②防治措施：施入过磷酸钙作基肥；选用1%～3%过磷酸钙浸出液或0.3%～0.5%磷酸二氢钾溶液对叶面进行喷雾防治，喷洒时间最好在早晨无露水时或傍晚，使溶液在叶面上保留一段时间，以便于吸收。
3）缺锌。①识别要点：叶易向外侧卷，茎秆上可发现色素。②防治措施：平衡施肥。缺锌时可以施用硫酸锌，每亩用1～1.5千克，也可用0.1%～0.2%硫酸锌水溶液喷洒叶面。
4）缺硼。①识别要点：其表现为叶柄异常肥大、短缩，并向内侧弯曲，弯曲部分的内侧组织变褐，逐渐龟裂，叶柄扭曲以致劈裂。由幼叶边缘向内逐渐褐变，最后新叶坏死。②防治措施：缺硼的原因，一是由于土壤中缺硼所致，二是土壤中其他营养元素偏多，因而抑制了植株对硼的正常吸收。另外，在高温干旱的条件下，也易发生缺硼症。如果土壤缺硼，每亩可施用硼砂1千克，以补充硼元素的不足。发现缺硼症状后，可用0.1%～0.3%硼砂水溶液，进行叶面喷雾。
5）烧心。①识别要点：生育前期较少出现，一般在植株长至11～12片叶时发生。②病因：主要是由缺钙引起的。③防治措施：栽培的芹菜易发生烧心，应从管理入手，做到温度、湿度适宜，对酸性土壤要施入石灰，将其调成中性，发病初期可喷洒0.5%硝酸钙溶液。
6）空心。①识别要点：空心是一种生理老化现象，多发生在砂壤土地上。②病因：一般发生在植株生长中后期，此外，土壤干旱时芹菜也易发生空心现象。③防治措施：应选择非砂性土壤种植，种植前施足腐熟的有机肥，适时追肥，发现叶色浅、脱肥时，可喷洒0.1%尿素水溶液2～3次。
7）叶柄开裂。①识别要点：叶柄开裂。②病因：土壤缺硼；在低温、干旱条件下，植株生长受阻所致。③防治措施：施足充分腐熟的有机肥，每亩施硼砂1千克，与有机肥充分混匀；叶面喷施0.1%～0.3%硼砂溶液，并在管理时注意浇水。
2.主要虫害防治
（1）白粉虱。①物理防治：设置黄板（1米×0.17米纤维板或硬纸板，涂成橙黄色，再涂上一层粘油， 每亩32～34块）诱杀成虫效果显著。黄板设置于行间、与植株高度相平，粘油（一般使用10号机油加少许黄油调匀）7～10天重涂一次，要防止油滴在作物上造成烧伤。②药剂防治：在温室白粉虱发生较重的保护地，可选用50克/升双丙环虫酯可分散液剂55～65毫升/亩对水60千克、10%溴氰虫酰胺可分散油悬浮剂33.3～40.0毫升/亩对水60千克、22.4%螺虫乙酯悬浮剂21.7～32.1毫升/亩对水60千克、2.5%溴氰菊酯乳油2000～3000倍液或10%吡虫啉（蚜虱净）可湿性粉剂4000～5000倍液等轮换喷雾防治；在保护地内，选用1%溴氰菊酯烟剂或20%氰戊菊酯（速灭杀丁）烟剂，用背负式机动发烟器施放烟剂，效果也很好。
（2）潜叶蝇。①利用黄板诱杀成虫。每亩大棚用黄板20～30块，每隔7～10天更换一次黄板。②抓住潜叶蝇产卵盛期至孵化初期的有利时机进行防治，可选用25%乙基多杀菌素水分散粒剂11～14克/亩对水60千克、10%溴氰虫酰胺可分散油悬浮剂14～18毫升/亩对水60千克、1.8%阿维菌素乳油2000倍液或10%灭蝇胺悬浮剂1500倍液等轮换喷雾防治。
（3）蚜虫。可选用50克/升双丙环虫酯可分散液剂10～16毫升/亩对水60千克、10%溴氰虫酰胺可分散油悬浮剂30～40毫升/亩对水60千克或14%氯虫·高氯氟微囊悬浮-悬浮剂5.1～10.2毫升/亩对水60千克等轮换喷雾防治。
芹菜的生长期一般需100～140天，常因播种期和品种的不同而异。同时芹菜的收获期也不是十分严格，因此可根据市场需求，在适期范围内排开播种，分期、分批上市。