藜麦的品种或生态类型有人工种植和野生之分，根据对主产区农业生态条件的适应情况可分为5大类：①谷地藜麦。分为两种亚型，一种生长在干旱峡谷（秘鲁胡宁），另一种生长在海拔2300～3500米、年降水量700～1500毫米，且最低平均温度为3℃的潮湿峡谷内；②高原藜麦。生长在海拔3000米以上，年降水量400～800毫米，最低平均温度为0℃的地区；③盐滩藜麦。生长在海拔近3000米，年降水量250～400毫米，平均温度为-1℃的地区；④低地藜麦。生长在海拔500米以下，年降水量800～1500毫米，最低平均温度为5℃的地区；⑤亚热带藜麦。生长在海拔1500～2300米，年降水量1000～2000毫米，最低平均温度为7℃的地区。
另一种分类方法是以藜麦的起源和用途为依据，据此可将目前种植的藜麦品种分为2类：①改良型或商用藜麦。通过试验选育或遗传改良后得到的品种。②传统型藜麦。经农民改良的品种。并可细分为白色小籽实藜麦、甜藜麦（皂苷含量低）和苦藜麦（皂苷含量高）。