7.4.2.1前期准备
畜禽粪便堆肥前，通过加入农业废弃物（如秸秆、谷糠、豆粕等）调节堆肥原料含水率（50%～65%）和碳氮比（25～35），并进行适当粉碎（粒径<60毫米），使堆肥原料达到发酵要求。
7.4.2.2初次发酵
初次发酵一般持续1～3周。堆肥开始后，每2天翻堆1次，每1天检测1次温度，温度上升至50℃以上时，可进入二次发酵。
7.4.2.3二次发酵
二次发酵一般持续3周。本阶段每3天翻堆1次，至少翻堆6次。在翻堆过程中，对大块物料进行适当破碎，也可适当补充物料。每天检测1次温度，温度保持在55～65℃之间，待温度开始下降时进入下一阶段。
7.4.2.4风干陈化
风干陈化期以降温为主，将堆体厚度平摊至0.5米进行降温。此过程一般持续1周。本阶段每3天翻堆一次，翻堆两次。每1天检测温度和含水率，当温度降至40℃、含水率稳定在30%以下时，腐熟结束，进入生产阶段。
7.4.2.5产品生产
添加缺少的营养元素，进行有机肥生产。